Skip to content

Spp 003 nl - #153

Open
karenwuyts wants to merge 140 commits into
mainfrom
spp-003-nl
Open

Spp 003 nl#153
karenwuyts wants to merge 140 commits into
mainfrom
spp-003-nl

Conversation

@karenwuyts

@karenwuyts karenwuyts commented Mar 25, 2026

Copy link
Copy Markdown

Description

This project-specific protocol describes the guidelines and steps for the manual installation of ground water wells in terrestrial and aquatic habitat types for monitoring of the ground water chemistry (nitrogen) for the Monitoring Programme for the Natural Environment (MNE; Meetnetten Natuurlijk Milieu, MNM). It makes use of protocol sfp_104_nl.

Related Issue

Task list

Steps by contributor:

  • Add description to this pull request (under "## Description")
  • Open the dropdown (triangle) near 'create pull request' and choose 'Create draft pull request'
  • Check for potential problems by running protocolhelper::check_frontmatter() and address them
  • Check for potential problems by running protocolhelper::check_structure() and address them
  • Add further commits if needed and push them to GitHub
  • Update the protocol-specific NEWS.Rmd
  • Mark the pull request as 'ready for review'

Review steps for the author(s):

  • Add reviewers, at least one subject-matter specialist and one administrator
  • Wait for review comments and address them
  • Iterate until reviewer approvals (merging the pull request will be done by an administrator)
  • Verify that the checks done by continuous integration succeeded. These will check if protocolhelper::check_frontmatter() and protocolhelper::check_structure() succeeded without errors.

To be done by an administrator after review: see guidelines for admins.

@ThierryO

Copy link
Copy Markdown
Member

@hansvancalster

  • the Docker issue is "package 'slickR' is not available"
  • you should remove the libs folder from the history and add it to the .gitignore

@hansvancalster

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

the Docker issue is "package 'slickR' is not available"

That is strange. The slickR package is no longer used. I guess that docker is using an old image?

  • you should remove the libs folder from the history and add it to the .gitignore

@karenwuyts The "remove the libs folder from the history" is something we will need to fix together. The update of .gitignore is something I must do via a separate pull request.

@ThierryO

ThierryO commented Mar 25, 2026

Copy link
Copy Markdown
Member

the Docker issue is "package 'slickR' is not available"

That is strange. The slickR package is no longer used. I guess that docker is using an old image?

"slickR",

This is due to the out of date branch. I would suggest to rebase this branch to the current main branch. This is something that @hansvancalster should fix.

Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/05_kwaliteitszorg.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd
Het terugvinden van aquatische steekproefeenheden vereist sowieso geen nauwkeurige locatiebepaling; een GPS-ontvanger zal daar volstaan.
Het vinden van een reeds geselecteerd staalnamepunt van een aquatisch type (zie [protocol spp-116-nl 2024.05](https://inbo.github.io/protocols/2024.05/index.html) en [protocol spp-117-nl 2024.06](https://inbo.github.io/protocols/2024.06/index.html) vereist wel het gebruik van een RTK-GPS-ontvanger.

## Optioneel: gebruik van bestaande meetlocaties

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
## Optioneel: gebruik van bestaande meetlocaties

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

moved section to line 131

Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd
Comment thread source/spp/mnm/spp_003_nl_peilbuisinst-mnm03.3/04_werkwijze.Rmd

@ToonVanDaele ToonVanDaele left a comment

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Mijn veldwerkervaring is al wat gedateerd, maar hier toch enkele algemene opmerkingen en suggesties:

  • Het protocol is heel helder. Als ik iets niet begreep is dat allicht omdat ik de bredere context niet helemaal ken.
  • Om verder af te stemmen zouden op termijn enkele topics aangepast kunnen worden in het sfp peilbuis plaatsen + bijkomende protocols opgemaakt voor het installeren, programmeren en uitlezen van de drukmeters (staat al lang op de todo lijst)
  • Ik begrijp niet waarom er verschillen zijn in de boordiepte naargelang de vegetatietypes. Het is erg ingewikkeld. Een paar zinnen die uitleggen waarom zou helpen. Het is ook niet duidelijk wat er met het meetpunt gebeurd wanneer er op de vooropgestelde diepte geen grondwater wordt aangetroffen. Soms staat er de meetnet coördinator contacteren, maar niet altijd.
  • De regel om niet dieper te boren dan 1m onder de huidige grondwaterstand is niet houdbaar. Tenzij er enkel meetpunten worden geplaatst op het ideale moment van het jaar (bij de laagste grondwaterwaterstand), is er altijd een interpretatie en inschatting nodig tijdens het plaatsen van het meetpunt. Misschien kan het nuttig zijn om later terug te komen? Misschien heeft Mathias hiervoor suggesties.
  • Voor de aanduiding van het type meetpunt is er een afzonderlijk veld. De honderdtallen en hoger worden gebruikt om bij clusters de onderlinge verhouding van de filterdieptes aan te duiden. Het wordt heel verwarrend als dit een dubbele betekenis krijgt. Een mogelijke suggestie is een andere letter gebruiken (vb. G van grondwaterstandsbuis) ipv P (piëzometer). - te bespreken met Mathias.
  • Bij het gebruik van bestaande meetpunten is volgens mij de positie van de standplaats in het landschap veel belangrijker dan de afstand. Bijvoorbeeld: een meetpunt <50m van de standplaats, maar vlak naast een waterloop is allicht niet representatief. Hierover best iets toevoegen.

-->
```

**Doeltype**: het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop (rbb) waarvoor de steekproeflocatie is getrokken voor een specifiek meetnet.

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
**Doeltype**: het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop (rbb) waarvoor de steekproeflocatie is getrokken voor een specifiek meetnet.
**Doeltype**: het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop (rbb) waarvoor de steekproeflocatie is getrokken voor het meetnet eutrofiëring via het grondwater.

```

**Doeltype**: het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop (rbb) waarvoor de steekproeflocatie is getrokken voor een specifiek meetnet.
Er komt geen overlap voor tussen sub- en hoofdtypes.

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
Er komt geen overlap voor tussen sub- en hoofdtypes.
Er is geen overlap tussen sub- en hoofdtypes.

De stijghoogte is de resultante van de hydraulische druk die ter hoogte van de filter in de ondergrond heerst.
De stijghoogte kan hoger, gelijk of lager zijn dan de grondwaterstand.
Bij de analyse van de chemische samenstelling heeft een piëzometer minder risico op invloed van insijpelend regenwater.
Bovendien wijkt de hydrostatische druk in de meeste gevallen niet of nauwelijks af van het grondwaterpeil als de piëzometer “kort” is (doorgaans \< 2-3 m).

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
Bovendien wijkt de hydrostatische druk in de meeste gevallen niet of nauwelijks af van het grondwaterpeil als de piëzometer “kort” is (doorgaans \< 2-3 m).
Bovendien wijkt het peil in de piëzometer in de meeste gevallen nauwelijks af van het grondwaterpeil als de filter niet veel dieper dan het grondwater zit (doorgaans < 2-3 m).


## Doelstelling en toepassingsgebied

Dit protocol beschrijft het manueel plaatsen van een koppel ondiepe peilbuis en ondiepe piëzometer met automatische druksensor in een geschikte terrestrische en aquatische steekproefeenheid van het meetnet eutrofiëring via het grondwater (meetnet GW_03.3).

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
Dit protocol beschrijft het manueel plaatsen van een koppel ondiepe peilbuis en ondiepe piëzometer met automatische druksensor in een geschikte terrestrische en aquatische steekproefeenheid van het meetnet eutrofiëring via het grondwater (meetnet GW_03.3).
Dit protocol beschrijft het manueel plaatsen van een koppel ondiepe peilbuis en ondiepe piëzometer met automatische druksensor in een geschikte terrestrische en aquatische steekproefeenheid van het **meetnet eutrofiëring via het grondwater (meetnet GW_03.3)**.


Controleer in de GIS-applicatie wie de eigenaar en/of beheerder is van het gebied waarin de steekproefeenheid gelegen is.

Controleer de toestand van de piëzometers die binnen een straal van 50m van het middelpunt van de steekproefeenheid liggen: - noteer de eigenaar van de piëzometer - controleer of de piëzometer binnen hetzelfde doeltype ligt als de steekproefeenheid op basis van de habitatkaart - controleer of de piëzometer binnen hetzelfde bodemtype ligt als de steekproefeenheid op basis van de bodemkaart.

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Niet de afstand, maar de positie in het landschap is hier cruciaal. Controleer zeker op mogelijk verschil in invloed van het oppervlaktewatersysteem, oppervlakkige afstroming en overstromingsdynamiek.

Wat gebeurt er als het bodemtype niet overeenkomt?
Ik weet niet hoeveel bodemtypes hier worden onderscheiden, maar op standplaatsniveau wijkt de textuurklasse van de bodemkaart heel vaak af van de effectieve textuur. Zeker in natste en venige locaties.


- als je de reductiehorizont niet herkent of tegenkomt boven de initiële boordiepte en je komt al grondwater tegen, boor dan tot 1 m onder de huidige grondwaterstand.

- Indien er geen grondwater voorkomt binnen de initiële boordiepte wijst dit op een op hydrologisch geïsoleerde plas met geen of maar heel beperkte grondwaterinvloed.

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Ik denk dat die conclusie niet zo snel genomen kan worden. Hier is een regel nodig ivm het seizoen waarin het meetpunt wordt geplaatst. In de winter kan de grondwaterstand veel hoger komen en wel degelijk invloed hebben op de plas.


Geef de buizen een watinacode conform protocol [sfp-104-nl](https://protocols.inbo.be/2025.01/index.html).
Bepaal eerst het volgnummer van de piëzometer op basis van de beschikbaarheid in Watina.
Voor de peilbuis gebruik je een volgnummer dat 100 volgnummers hoger ligt dan de piëzometer (vb. ZWAP101 en ZWAP001).

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Dit wordt erg verwarrend, want het 100, 200, ... + volgnummer systeem wordt al gebruikt om de ondiepe en diepere filters te onderscheiden. Als ik het goed heb is in watina een afzonderlijk veld voor peilbuis en piëzometer voorzien (net als peillat, ...) .

- Zelfstandigheid: de veldmedewerker moet in staat zijn om het veldwerk zelfstandig uit te voeren. Uiteraard is het steeds mogelijk om inhoudelijke of praktische bijstand te vragen aan collega’s binnen en buiten het projectteam.
- Goed vermogen tot samenwerken en communiceren
- Fysiek in staat om het protocol in veilige omstandigheden te kunnen uitvoeren.

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
- voldoende kennis bodemkunde om een eenvoudige bodembeschrijving met belangrijkste kenmerken op te maken (textuur, kleur, gley, structuren, ...)

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

het staat ook al wel in de sfp peilbuis plaatsen

afh_aq = c("GD2", "GD2", "GD2", "GD2", "GD2", "GD2", "GD2", rep("", 22))
)

output_table <- kbl(gd_data,

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Ik denk dat tabel redundante informatie geeft. Het veld 'afh_aq' is altijd hetzelfde voor de hele volledige kolom. Dit kan dus weg. Niet?


```{r gd-table, echo=FALSE, message=FALSE, warning=FALSE}
library(knitr)
library(kableExtra)

Copy link
Copy Markdown
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

kableExtra is not included in the renv lock file. If the package is not installed, it will not render the table.

Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment

Labels

None yet

Projects

None yet

Development

Successfully merging this pull request may close these issues.

10 participants